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Assim como na primeira Total Drama Island, esta temporada também se passa na Ilha de Wawanakwa em Muskoka, Ontário, e todos os antigos concorrentes foram excluídos e substituídos por 13 novos concorrentes, apenas. Os campistas são divididos em duas equipes, As Larvas Mutantes e Os Ratos Radioativos, que batalham por ganhar para não terem que votar na eliminação de um dos seus colegas de equipe.